为应对日益严峻的环境污染形势，环保部将改革环境影响评价，“三同时”验收，总量控制等环境管理制度，建立起以排污许可证为核心的统一环境管理制度，以应对严峻的环境污染形势。
环保部部长陈吉宁指出，现行各项环境管理制度之间衔接不够，制度实施不协调，尤其缺少对拒不领证，逾期拒不改正的制约措施，导致环保部门对环境违法行为难以实施有效监管和处罚，环保部下一步将通过排污许可证制度，规范企业的污染排放行为，实行多污染物协同控制，解决好固定源的稳定达标问题。
“比较清晰的知道，我们到底有多少污染物排放到环境里面，而且这些污染物排放应该是在我们要求的环境质量标准，排放的标准与环境质量的要求下制定出来的排放许可，因此如果说我们每一个地方，都按照排污许可的要求，进行规范性排放的话，那么环境质量就可能得到进一步的保障，”南京大学环境学院院长毕军称。
环保部表示，将实行制度融合，一企一证，统筹考虑水、大气、固体废弃物等污染要素，实现对排放企业建设、试生产、运营全过程的管理，以更好达到企业守法，政府执法，社会监督的目的。
